Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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PcolceQ61398 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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PcolceQ61398 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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PcolceQ61398 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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PcolceQ61398 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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PcolceQ61398 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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PcolceQ61398 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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PcolceQ61398 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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PcolceQ61398 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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PcolceQ61398 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PcolceQ61398 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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