Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
JrkQ60976 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
JrkQ60976 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms