Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Usp30Q3UN04 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Usp30Q3UN04 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Usp30Q3UN04 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Usp30Q3UN04 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Usp30Q3UN04 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Usp30Q3UN04 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Usp30Q3UN04 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Usp30Q3UN04 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Usp30Q3UN04 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Usp30Q3UN04 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Usp30Q3UN04 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Usp30Q3UN04 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Usp30Q3UN04 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Usp30Q3UN04 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Usp30Q3UN04 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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