Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Edc4Q3UJB9 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Edc4Q3UJB9 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Edc4Q3UJB9 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Edc4Q3UJB9 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edc4Q3UJB9 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edc4Q3UJB9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edc4Q3UJB9 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edc4Q3UJB9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edc4Q3UJB9 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edc4Q3UJB9 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edc4Q3UJB9 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edc4Q3UJB9 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edc4Q3UJB9 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edc4Q3UJB9 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edc4Q3UJB9 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Edc4Q3UJB9 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Edc4Q3UJB9 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Edc4Q3UJB9 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edc4Q3UJB9 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Edc4Q3UJB9 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edc4Q3UJB9 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edc4Q3UJB9 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edc4Q3UJB9 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edc4Q3UJB9 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edc4Q3UJB9 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edc4Q3UJB9 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edc4Q3UJB9 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Edc4Q3UJB9 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edc4Q3UJB9 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edc4Q3UJB9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edc4Q3UJB9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edc4Q3UJB9 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edc4Q3UJB9 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edc4Q3UJB9 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edc4Q3UJB9 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edc4Q3UJB9 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edc4Q3UJB9 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edc4Q3UJB9 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edc4Q3UJB9 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edc4Q3UJB9 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edc4Q3UJB9 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms