Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Cdh23-202ENSMUST00000105461 11096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Sv2b-201ENSMUST00000085164 5307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Cpsf1-201ENSMUST00000071898 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Ccdc141-207ENSMUST00000164114 6222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Col12a1-201ENSMUST00000071750 11511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 L3mbtl3-201ENSMUST00000040219 4572 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Kcnmb1-201ENSMUST00000020362 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Smcr8-201ENSMUST00000056907 7391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Itgam-201ENSMUST00000064821 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Csf2rb2-201ENSMUST00000096356 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Add2-209ENSMUST00000204059 8182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Myo16-202ENSMUST00000207204 6719 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Zkscan1-204ENSMUST00000110963 4670 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Cops9Q3U898 Ncapg2-201ENSMUST00000084828 4684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms