Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Treml4Q3LRV9 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
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