Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Samd11Q1RNF8 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
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Samd11Q1RNF8 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Samd11Q1RNF8 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms