Protein–RNA interactions for Protein: Q14B70

Hdx, Highly divergent homeobox, mousemouse

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Length 692 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdxQ14B70 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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HdxQ14B70 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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HdxQ14B70 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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HdxQ14B70 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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HdxQ14B70 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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HdxQ14B70 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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HdxQ14B70 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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HdxQ14B70 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HdxQ14B70 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms