Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Itgb8Q0VBD0 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Itgb8Q0VBD0 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Itgb8Q0VBD0 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
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