Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Msx2Q03358 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms