Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms