Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Grin2cQ01098 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134 ms