Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gjb2Q00977 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms