Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Pou1f1Q00286 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Pou1f1Q00286 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Pou1f1Q00286 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Pou1f1Q00286 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Pou1f1Q00286 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Pou1f1Q00286 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Pou1f1Q00286 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Pou1f1Q00286 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pou1f1Q00286 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms