Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Ftsj3-201ENSMUST00000021048 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Btn1a1-201ENSMUST00000041674 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Lama5-201ENSMUST00000015791 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Gm15666-202ENSMUST00000219490 2796 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Tep1-201ENSMUST00000006444 8171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Acox3-201ENSMUST00000068563 3386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Stard13-201ENSMUST00000062015 5526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Arhgap32-206ENSMUST00000182802 5621 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Ighg3-202ENSMUST00000223179 2414 ntAPPRIS P5 BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Olfr23-202ENSMUST00000214210 2527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Dcun1d4-201ENSMUST00000063882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Sardh-202ENSMUST00000102886 4521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Apex2-203ENSMUST00000112720 4742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Gm12592-201ENSMUST00000155332 2954 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Dhx35-202ENSMUST00000109478 3284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Galnt16-201ENSMUST00000021558 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Olfr376-202ENSMUST00000120401 3342 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Slc26a1-202ENSMUST00000119270 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Stx12-201ENSMUST00000030698 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Pus7l-201ENSMUST00000049151 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Fbxo7-204ENSMUST00000130320 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Cited1P97769 Heatr6-201ENSMUST00000001002 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Cited1P97769 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Cited1P97769 Scn4a-201ENSMUST00000021056 6598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Cited1P97769 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Cited1P97769 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Cited1P97769 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Cited1P97769 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Cited1P97769 Cyp51-201ENSMUST00000001507 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Cited1P97769 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
Cited1P97769 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Cited1P97769 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Cited1P97769 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Cited1P97769 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Cited1P97769 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Cited1P97769 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Cited1P97769 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Cited1P97769 Gm26836-201ENSMUST00000181056 1568 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Cited1P97769 5430416N02Rik-201ENSMUST00000180779 3486 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Cited1P97769 Wnk4-201ENSMUST00000103108 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Cited1P97769 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Cited1P97769 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Cited1P97769 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Cited1P97769 Spocd1-201ENSMUST00000084263 3096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Cited1P97769 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Cited1P97769 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Cited1P97769 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Cited1P97769 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Cited1P97769 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Cited1P97769 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Cited1P97769 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Cited1P97769 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms