Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nbr1P97432 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nbr1P97432 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nbr1P97432 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nbr1P97432 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nbr1P97432 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nbr1P97432 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nbr1P97432 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nbr1P97432 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nbr1P97432 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nbr1P97432 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nbr1P97432 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nbr1P97432 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nbr1P97432 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nbr1P97432 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nbr1P97432 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nbr1P97432 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nbr1P97432 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nbr1P97432 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nbr1P97432 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nbr1P97432 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nbr1P97432 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nbr1P97432 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nbr1P97432 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nbr1P97432 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nbr1P97432 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms