Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
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SgcdP82347 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 H2-Ob-201ENSMUST00000095342 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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