Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Irx1P81068 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms