Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

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Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx3P81067 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx3P81067 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx3P81067 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx3P81067 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx3P81067 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx3P81067 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx3P81067 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx3P81067 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx3P81067 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx3P81067 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx3P81067 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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