Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Lrtm1-203ENSMUST00000224760 3060 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Vbp1P61759 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Vbp1P61759 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vbp1P61759 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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