Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cldn18P56857 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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