Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VdrP48281 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VdrP48281 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VdrP48281 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VdrP48281 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VdrP48281 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VdrP48281 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VdrP48281 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VdrP48281 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VdrP48281 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
VdrP48281 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VdrP48281 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VdrP48281 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VdrP48281 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VdrP48281 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VdrP48281 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm30655-201ENSMUST00000220498 1383 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
VdrP48281 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VdrP48281 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VdrP48281 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VdrP48281 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
VdrP48281 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VdrP48281 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VdrP48281 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VdrP48281 H2-Ob-201ENSMUST00000095342 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VdrP48281 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VdrP48281 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VdrP48281 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VdrP48281 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VdrP48281 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VdrP48281 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VdrP48281 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VdrP48281 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VdrP48281 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
VdrP48281 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VdrP48281 Dyrk1a-203ENSMUST00000122284 2356 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VdrP48281 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
VdrP48281 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VdrP48281 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VdrP48281 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VdrP48281 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
VdrP48281 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VdrP48281 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VdrP48281 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
VdrP48281 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
VdrP48281 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
VdrP48281 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms