Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms