Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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Hoxd10P28359 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Hoxd10P28359 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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Hoxd10P28359 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Hoxd10P28359 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Hoxd10P28359 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Hoxd10P28359 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Hoxd10P28359 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Hoxd10P28359 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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Hoxd10P28359 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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