Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Defa5P28312 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Celf1-208ENSMUST00000111455 7579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Defa5P28312 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Scn4a-201ENSMUST00000021056 6598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms