Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P10404 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P10404 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
P10404 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P10404 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
P10404 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
P10404 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
P10404 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
P10404 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
P10404 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
P10404 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
P10404 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
P10404 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P10404 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
P10404 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P10404 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P10404 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P10404 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P10404 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
P10404 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P10404 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P10404 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P10404 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
P10404 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
P10404 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
P10404 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
P10404 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
P10404 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
P10404 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
P10404 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
P10404 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
P10404 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
P10404 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
P10404 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
P10404 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
P10404 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P10404 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
P10404 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P10404 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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P10404 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P10404 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P10404 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P10404 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P10404 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P10404 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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P10404 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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P10404 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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P10404 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P10404 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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P10404 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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P10404 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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P10404 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
P10404 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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