Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprcP06800 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprcP06800 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprcP06800 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprcP06800 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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PtprcP06800 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprcP06800 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprcP06800 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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PtprcP06800 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprcP06800 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprcP06800 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprcP06800 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprcP06800 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms