Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Npas4-201ENSMUST00000056129 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptpn20O55082 Dram2-202ENSMUST00000067630 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptpn20O55082 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptpn20O55082 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptpn20O55082 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptpn20O55082 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptpn20O55082 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptpn20O55082 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptpn20O55082 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptpn20O55082 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptpn20O55082 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptpn20O55082 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptpn20O55082 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptpn20O55082 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptpn20O55082 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptpn20O55082 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptpn20O55082 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptpn20O55082 Upp2-201ENSMUST00000059102 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptpn20O55082 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptpn20O55082 Slco5a1-205ENSMUST00000146763 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptpn20O55082 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptpn20O55082 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptpn20O55082 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptpn20O55082 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptpn20O55082 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptpn20O55082 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptpn20O55082 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptpn20O55082 Gm35715-201ENSMUST00000197421 2054 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptpn20O55082 Ovgp1-201ENSMUST00000000573 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptpn20O55082 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ptpn20O55082 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ptpn20O55082 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ptpn20O55082 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ptpn20O55082 1700030K09Rik-201ENSMUST00000064853 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ptpn20O55082 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ptpn20O55082 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ptpn20O55082 2810029C07Rik-201ENSMUST00000180698 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ptpn20O55082 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ptpn20O55082 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ptpn20O55082 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Miga2-202ENSMUST00000100214 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm10804-201ENSMUST00000099693 2244 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Hsp90aa1-202ENSMUST00000094361 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Osbpl5-202ENSMUST00000119499 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Cep95-202ENSMUST00000103068 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Tmem63a-201ENSMUST00000027800 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm15612-201ENSMUST00000147542 3118 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Slc37a2-202ENSMUST00000161114 2945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Rbm10-203ENSMUST00000084383 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm45889-202ENSMUST00000211255 2358 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms