Protein–RNA interactions for Protein: O54836

Zmat3, Zinc finger matrin-type protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat3O54836 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Zmat3O54836 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zmat3O54836 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms