Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Efna3O08545 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms