Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm42995-201ENSMUST00000197047 1330 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms