Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Gm6820-201ENSMUST00000188803 2173 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Pclaf-201ENSMUST00000045802 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Aldh18a1-201ENSMUST00000025979 3527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Slco1c1-206ENSMUST00000205214 2515 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Cyld-205ENSMUST00000209532 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Foxn1-201ENSMUST00000108294 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm36948-201ENSMUST00000194708 3247 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Rpgr-205ENSMUST00000115533 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Cnpy4-202ENSMUST00000110934 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Slc7a9-202ENSMUST00000118383 1869 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Dhcr7-202ENSMUST00000124340 2556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Rnf43-209ENSMUST00000165679 4310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Zfp936-203ENSMUST00000202535 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Def8-202ENSMUST00000065534 3127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Cep63-206ENSMUST00000162655 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Ndrg3-203ENSMUST00000109558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Uqcc1-204ENSMUST00000109636 2633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Arhgap26-216ENSMUST00000155576 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Slc7a9-201ENSMUST00000032703 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Mkl2-201ENSMUST00000009713 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm35725-201ENSMUST00000221862 2800 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm8346-201ENSMUST00000178968 1769 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Trpv1-202ENSMUST00000102526 3361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Aftph-209ENSMUST00000177543 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Nif3l1-202ENSMUST00000114337 2168 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Fam212b-201ENSMUST00000066610 4701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 4833417C18Rik-201ENSMUST00000146868 1269 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm18943-201ENSMUST00000207357 1216 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 AC163651.1-201ENSMUST00000222500 372 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 AC116487.1-201ENSMUST00000227033 339 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 AC113304.1-201ENSMUST00000214014 1833 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Rasgrf1-203ENSMUST00000189545 4766 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm44280-201ENSMUST00000204498 3111 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Rnf185-202ENSMUST00000077078 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm36988-201ENSMUST00000194090 2408 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Slc36a2-201ENSMUST00000039305 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 1300002E11Rik-201ENSMUST00000180830 3557 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Cd300e-201ENSMUST00000062787 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Prdx1-204ENSMUST00000135573 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Olfr115-202ENSMUST00000221552 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Tbc1d24-204ENSMUST00000167791 4383 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Lpar1-204ENSMUST00000107574 3437 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Bbs9-211ENSMUST00000150395 3425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Acvr1-203ENSMUST00000112599 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Cdh16-204ENSMUST00000211903 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Glp2r-201ENSMUST00000021289 1738 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Itm2a-201ENSMUST00000033591 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 D630003M21Rik-203ENSMUST00000169335 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Gm20538F6Z9R1 Rnf222-201ENSMUST00000065213 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms