Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myo5cE9Q1F5 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms