Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Sh2d1a-203ENSMUST00000115070 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm17147-201ENSMUST00000164176 432 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm24466-201ENSMUST00000179978 109 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm31678-201ENSMUST00000198262 454 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Prss23os-203ENSMUST00000208814 975 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Prss23os-204ENSMUST00000209064 972 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 AC164978.2-201ENSMUST00000226645 857 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 AC123061.1-201ENSMUST00000228021 999 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Oprk1-201ENSMUST00000027038 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm13547-202ENSMUST00000113810 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 1700026D11Rik-205ENSMUST00000151417 789 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm32102-201ENSMUST00000196885 241 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm40153-201ENSMUST00000197904 637 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm34397-201ENSMUST00000213192 708 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 AC124772.3-201ENSMUST00000222535 575 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm36211-201ENSMUST00000198171 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm15720-201ENSMUST00000117133 282 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm8754-201ENSMUST00000118391 520 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm43103-201ENSMUST00000199021 802 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 3830406C13Rik-213ENSMUST00000225294 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 AC116596.1-201ENSMUST00000228112 1762 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 9530059O14Rik-204ENSMUST00000215759 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Slc25a14-208ENSMUST00000177710 1516 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Fcrl1-206ENSMUST00000194786 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 1810058I24Rik-201ENSMUST00000130875 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm9273-201ENSMUST00000200606 715 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fndc1E9Q043 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms