Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ssxb8B1AY40 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ssxb8B1AY40 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ssxb8B1AY40 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ssxb8B1AY40 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ssxb8B1AY40 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ssxb8B1AY40 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Ssxb8B1AY40 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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