Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Syndig1A2ANU3 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms