Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
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