Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs4Q9Z1T2 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Thbs4Q9Z1T2 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Thbs4Q9Z1T2 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Thbs4Q9Z1T2 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Thbs4Q9Z1T2 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Thbs4Q9Z1T2 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Thbs4Q9Z1T2 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Thbs4Q9Z1T2 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Thbs4Q9Z1T2 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Thbs4Q9Z1T2 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Thbs4Q9Z1T2 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Thbs4Q9Z1T2 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs4Q9Z1T2 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs4Q9Z1T2 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs4Q9Z1T2 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs4Q9Z1T2 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs4Q9Z1T2 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs4Q9Z1T2 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs4Q9Z1T2 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs4Q9Z1T2 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs4Q9Z1T2 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs4Q9Z1T2 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs4Q9Z1T2 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs4Q9Z1T2 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs4Q9Z1T2 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs4Q9Z1T2 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs4Q9Z1T2 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs4Q9Z1T2 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs4Q9Z1T2 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs4Q9Z1T2 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs4Q9Z1T2 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs4Q9Z1T2 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs4Q9Z1T2 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs4Q9Z1T2 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs4Q9Z1T2 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs4Q9Z1T2 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs4Q9Z1T2 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs4Q9Z1T2 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms