Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PplQ9R269 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PplQ9R269 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PplQ9R269 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PplQ9R269 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PplQ9R269 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PplQ9R269 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PplQ9R269 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PplQ9R269 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PplQ9R269 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PplQ9R269 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PplQ9R269 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms