Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr5Q9JLF7 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tlr5Q9JLF7 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tlr5Q9JLF7 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tlr5Q9JLF7 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tlr5Q9JLF7 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tlr5Q9JLF7 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tlr5Q9JLF7 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr5Q9JLF7 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr5Q9JLF7 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr5Q9JLF7 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr5Q9JLF7 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr5Q9JLF7 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr5Q9JLF7 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr5Q9JLF7 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr5Q9JLF7 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr5Q9JLF7 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr5Q9JLF7 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr5Q9JLF7 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr5Q9JLF7 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr5Q9JLF7 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr5Q9JLF7 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr5Q9JLF7 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr5Q9JLF7 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr5Q9JLF7 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr5Q9JLF7 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr5Q9JLF7 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr5Q9JLF7 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr5Q9JLF7 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr5Q9JLF7 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr5Q9JLF7 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms