Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Mrpl39Q9JKF7 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Mrpl39Q9JKF7 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms