Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ap4m1Q9JKC7 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms