Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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OtofQ9ESF1 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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