Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms