Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra4Q9D6F4 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms