Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trmt44Q9D2Q2 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trmt44Q9D2Q2 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms