Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rfc5Q9D0F6 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms