Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 M1ap-201ENSMUST00000113980 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpusd4Q9CWX4 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms