Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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