Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atp5f1Q9CQQ7 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atp5f1Q9CQQ7 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms